A játékosok játszanak „EteRNA” Just Beat professzionális tudományt a kulcsfontosságú felfedezéshez

A polgári tudomány csak a következő szintre lépett: a videojátékosok biológiai felfedezést tettek, és ezt a szakértői folyóirat közzétette.

Megjelent a héten a Journal of Molecular Biology, egy sor intuitívan kidolgozott szabály, hogy milyen nehéz egy adott alakot elérni az RNS-tervezés révén. Megállapították például, hogy minél szimmetrikusabb az alakja, annál nehezebb lesz megtervezni az RNS egy szálát.

A videojátékok kollektívája a felfedezést játszotta, Eterna, egy olyan játék, amely kihívást jelent a játékosoknak, hogy vegyenek RNS szálakat, és kémiai sminkük megváltoztatásával hajtsák végre őket a kívánt formába. Az RNS egy bizonyos alakzatba történő összecsukása tudományos problémája összetett, de a játék nem - a játék megkezdéséhez nincs szükség a biokémia megértésére.

A játékosok saját kezdeményezésükre vitték fel a kutatási kérdést, hogy az újabb játékosok számára lehetővé tegyék a különböző rejtvények viszonylagos nehézségének megítélését. Az eredmények segítenek a jövőbeni biomedicinális kutatások irányában, mivel az új szabályrendszer a tudósok számára jobb érzést ad arról, hogy az RNS-nek egy adott alakba történő összecsukása egy hiábavaló gyakorlat.

„Ez a kutatás arra enged következtetni, hogy a tudományos közbeszerzés szokásos paradigmája átfordítható” - mondja Rhios Das, a Stanfordban a biokémia professzora. fordítottja e-mailben. Eterna 2011-ben Das és Adrien Treuille, a Carnegie Mellon Egyetem számítástechnikai tanszékvezetője indította el. „ Eterna a játékosok saját kutatási kérdéseket dolgozhatnak ki, és saját papírjaikat felírhatják. Ebben a kutatásban egy kis útmutatást és független vizsgálatot végeztek a laborom szakértőitől.

A szintetizált RNS hihetetlen potenciállal rendelkezik egy új generációs gyógyszerek és gyógykezelések számára. Ha a megfelelő alakba lehet hajtani, az RNS-t úgy alakíthatjuk ki, hogy specifikus vírusokat, rákokat és még genetikai rendellenességeket is megcélozzon. A CRISPR, egy olyan génszerkesztő folyamat, amely drámai módon megváltoztathatja az emberi lét jövőjét, RNS-t használ a DNS-vágó enzim (Cas9) irányításához a DNS nemkívánatos részéhez.

Eterna a szakértők tudósai számára fórumot indítottak, hogy bemutassák a rejtvényeket a játékosoknak, de azóta meghaladta ezt. A játék és a 100 000 regisztrált játékos most már szimbiotikus és fejlődő kapcsolatban áll a professzionális tudósokkal és az RNS struktúrájának tervezésére és tesztelésére épített számítógépes modellekkel.

„Számítógépes modellezés és Eterna nem kizárólagosak ”- mondja Das. „ Eterna sok embert hoz össze, akik közül néhányan saját számítógépes modelljeiket írják. ”

A jelenlegi dokumentumban a játékosok közösen írtak szkriptet, hogy teszteljék ötleteiket, hogy miért nehezen tervezhető meg az RNS-struktúrák. Das azt mondja, hogy néhány játékos elmondta neki, hogy különösen izgatottak, hogy automatizálják ötleteiket számítógépes modellekbe, mert tovább akarnak lépni és megoldani a nehezebb problémákat.

Problémák a Eterna A játékosok ténylegesen Das laboratóriumában szintetizálódnak - eddig 86 459 játékos által generált szekvenciát építettek be az IRL-be.

A papír vezető szerzői voltak Eterna Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju és Michelle Wu játékosai. Wu is Ph.D. a Stanford-i orvosbiológiai informatika hallgatója.

A jövőben az is lehet, hogy a polgári szakértők a tudományos felfedezéseket önállóan kezdenek kiadni.

„Ez a„ fliped crowdsourcing ”sablon a polgári tudomány számára hasznos lehet más projekteknél és tudományterületeken, mint például a csillagászat (Galaxis állatkert) vagy tömegből származó fajok azonosítása (Az élet vonalkódja) ”- mondja Das. - Különösen, ha úgy tetszik Eterna, szűk keresztmetszeteket látnak a papírírás szakaszában. ”